Permedia2にくらべるとVoodooBansheeは発熱が多いので
一度、筐体内部の廃熱を見直すというのはいかが？

どの様な場面でフリーズするのでしょうか？
もしＷＥＢ閲覧中にフリーズするのでしたら、ドライバ設定→２Ｄ設定 ビットマップキャッシュを無効にしてみましょう。
★IE のバージョンが関係するみたいですが IE5.5 だとどうなるのか確認してません（汗

過去ログ）
http://www.griffonworks.homeip.net/dorlog/2nddorcom/pc-98/thread03316.html

ZJIさん、いーとんさん、コメントありがとうございます。
皆さんのところでは、そういう症状はないみたいですね。
NECフィールディングでマザーボードも交換したのですが、私の環境ではすぐにフリーズします。
IEはフリーズしながらもなんとか6.0SP1にしました。17回も再インストールしましたが(^^;;・・・
Office2000はフリーズで完全にはインストールできていません。もう再インストールは疲れたのでそのままです。換気口の風は涼しいので廃熱がたまっているとは思いにくいのですが・・・
フリーズはあらゆる場面でフリーズしますがスキャンディスクをすると一発でフリーズします。

電源が腐ってるとかはないですか？

＞換気口の風は涼しいので廃熱がたまっているとは思いにくいのですが・・・

デスクトップ筐体は上手く空気が循環しないので、換気口で確かめるよりもケースの
上側（PCIスロット辺り）を触って確かめてみると良いかも知れません。
もし熱い、とか暖かいとかなってればVDB16自身が熱でやられかけてる可能性もあるの
ではないかと。

＞フリーズはあらゆる場面でフリーズしますがスキャンディスクをすると一発でフリーズします。

一応、使っているHDDと接続しているI/Fも挙げておいた方が良いかも。
環境が分かればまた違った意見も出てくるかも知れないので。

SSBさん、Kameさん、コメントありがとうございます。
電源は、買って2年位の時、バックアップの電池が消耗してしまって、当時のカスタマーサポートに見てもらっています。それ以降は、GA-VDB16/PCIを使わない限り異常は出ません。
それから、ケースの上側を触るとわずかに暖かい感じがします。GA-VDB16/PCI自体、ヒートシンクではなく、ファンを使っているので発熱は多いと思います。しかし、PC/AT互換機も持っていますが、それに比べれば遥かに少ないのですが、PC-98はそんなに弱いのでしょうか。それであれば、GA-VDB16/PCIの箱に対応機種として挙がっていないと思うのですが・・・
HDDはDBI-N4.3GTを2台載せています。I/FはDBI-N4.3GTに付いてきたのを使っています。
いわゆる内蔵型です。4.3GBなので、FAT32でフォーマットしてありますが・・・

GA-VDB16/PCIが死亡寸前と言うことはないでしょうか。とりあえず、クロックを落としてみてはどうでしょうか。家のはすでに昇天してます。

Anpanさん、コメントありがとうございます。前にも書きましたが、GA-VDB16/PCIはこれで3台目なんですよ。どれもこれも同じようにフリーズしました。その前のGA-PIIH8/PCIの調子が良かっただけに残念です。現在メモリクロック90MHz、コアクロック90MHzまで落としていますが、特有の症状は消えません。マザーボードもこの前、NECフィールディングに交換してもらったのですが変わりません。

確か、GA-VDB16/PCIって、結構使用機種が限定されてた気がします。
特に、山猫機は作動が不安定とか言う話を随分前に、ここで見た記憶が・・・。(^^ゞ

Bansheeは相当な電力食いの上、DBI-N4.3GTを2台載せているとのことですので電源が
貧血状態になっているのではないでしょうか？
以前Xa7にGA-VDB16/PCIとUIDE-66経由でDTLA-307030を2台載せていましたが、
176Wの電源でもなんとか歯を食いしばって持ちこたえていました。
デスクトップValuestarの電源には150W程度の出力しかないものもありますので
一度確かめられてはどうでしょう。

DBI-N4.3GTを1台に減らして電源への負荷を下げるとGA-VDB16/PCIが安定するなら明らかです。

またGA-PIIH8/PCIが不調になった時の状況が知りたいです。
DBI-N4.3GTを2台載せたら不調になったのならまさに電源の貧血です。

ZADさん、Nr166erさん、ご返事ありがとうございます。箱を見るとV16/S5C2はいいようです。S5Vがダメなようです。 Valuestarの電源も確か176Wでした。PCIバス1本、Cバス2本しかないので、他機種より負荷は少ないと思います。山猫機種の不安定さはあると思います。 GA-PIIH8/PCIの不具合は画面が砂嵐になってしまうもので、寿命だと思われます。もうPC-9821はやめようかと思っていますが、愛着があるもので主につかっています。(^^;;

それなら尚のこと、別のグラフィックボードを探してはどうでしょうか？
まめに探せば見つかると思いますよ。
多少性能は落ちますが、メルコの製品なんかも良いと思います。

CPUはノーマルですか？（当方K6-2-400MHz＠N下駄）
あと、ドライバーは最新ものを入れてますか？（当方ver1.30）
V13S5ですが、発売日に買ってから、不具合は出ていません。
内蔵ハード２台とＣバスにNICで、電源の問題も出ていません。
ボードはノーマル設定で使っています。

ZADさん、xyz@V13使ひさん、ご返事ありがとうございます。
もう、グラフィックボードにお金をかけるのはやめました。昨日、見たら内蔵のCirrusも死んでいました。(TT
ドライバは上記のようにVer1.40で最新です。CPUがK6III550MHz@N4下駄なほかは、CバスにNICで4.3GB2台です。あとはCバスにPC-9800-100SCSI-2です。
不具合がないそうでうらやましい限りです。こちらは、買ったパソコン店は潰れるし、NECには修理で4万円以上取られるしで、さっぱりです。

あぁ、ハイスペック山猫でしたのに、残念ですね。
御愁傷様です。