もし間違っていたら平に御容赦下さい。
「I/O error」のメッセージが出たと致しますと、取り合えず4つ程原因が考えられます。
1.FDDとマザーボード間のケーブルが外れている(か差込が甘く接触不良を起こしている)
2.FDD内部に埃が溜まっていて読み込み出来ない
3.FDD自体が故障している。
4.セットアップディスク自体が破損している。
他にもあるかもしれません。「COMPA55」さんは今までPC/AT互換機を使用されていてPC-98*1は初めて使用されるのですよね。と致しますと、今現在の状況から直ぐにでも試せる事は「1.」位でしょうか(FDD用のクリーニングキットを御持ちでしたら「2.」も可能ですね)。もし「1.」「2.」を試した結果、改善されなければ少し面倒な事になると思います。知人にPC-98*1を使っている人がいたらそのセットアップディスクが破損していないかチェックして貰い、問題がなければ最悪「3.」のFDD故障が考えられて修理・交換となり費用が掛かります。もし「4.」であればPC-98*1用のOS(この場合ですとMS-DOS)を買い直して起動ディスクを入手するか日本電気に問い合わせて復旧して貰う必要があります(現在も復旧サービスを行っているかは不明です)。
それから余計な御世話と叱られてしまうかもしれませんが、ここ「どるこむ」には過去から蓄積された膨大なデータがあって、それを検索出来るサービスも有志の方々から提供されています。今回の件は別として、もし次に何か解らない事があったら最初にそちらを利用するのも一つの手だと思います。
トップページの左端にある紺の部分をスクロールしますと「過去ログ検索」と出てきますのでそこから入れます。試しに「I/O error」で検索してみた結果、全部はチェックしていないのですが例えば
http://www.cham-reo.com/logsearch/Log.aspx?c=pc-98&d=20001104T235048&id=20684とか
http://www.cham-reo.com/logsearch/Log.aspx?c=pc-98&d=20001104T235048&id=20684といった有意義な情報が得られます。