>原因と対策が知りたいです。
■原因
起動ドライブのルートフォルダにある「Msdos.sys」内の記述が"ロゴを表示しない(LOGO=0)"となっていると思われます。
■対策
「Msdos.sys」を直接メモ帳で開き、"ロゴを表示する(LOGO=1)"とするのが御手軽ですが、不安でしたら以下の方法もあります。
http://www.asahi-net.or.jp/~vr4m-ikw/download.htmlにて「窓の手」をダウンロードして下さい。次にこれを解凍後、起動して「ブート」タブをクリック。そうしますと、「アニメーションロゴを表示」という項目がありますから、もしそのチェックが外れていたらクリックしてチェックマークを付けて下さい。最後に最下部にある「設定反映」ボタンをクリックして再起動すればOKです。
>サイズ、色数も正しいようです。
とはもしかして御自分でlogo.sysを作成されたのでしょうか?