vjoyd.vxd というファイル名が DirectX かなにかと衝突しているようです。
WaveStar のドライバの方の vjoyd.vxd を使用するようにすると認識されました。
あくまで私のところで起こった症例ですが。

　マイクロソフトから下記いすれかをダウンロードしてください。
　
vjoyd118.exe - NEC製 118 サウンドボード用 修正モジュール(94k)
vjoydnew.exe - NEC製 118 サウンドボード以外の 修正モジュール(94k)

便乗質問ですみません。＞NABEKINさん。
>vjoyd118.exe - NEC製 118 サウンドボード用 修正モジュール(94k)
>vjoydnew.exe - NEC製 118 サウンドボード以外の 修正モジュール(94k)
以上の修正モジュールはMSのどこにあるのでしょうか？MSのサイトを散々探しまくったのですが、見つかりません。お教え願えないでしょうか？

レスありがとうございます。
すーゆーさんのお教えとうりvjoyd.vxdをWin98のと交換したりしてみましたが、残念ながら認識されませんでした。
NABEKINさんの修正モジュールはマイクロソフトで見つけることができませんでした。
置いてある場所を教えていただけないでしょうか？
よろしくお願いします。

遅くなりました。Ｆ−１１７さん

今回の修正モジュールはDirectＸ 5.0 NEC PC-98 用の修正モジュールですが
DirectＸ 6.１に付属のvjoyd.vxdよりバージョンが上になりますので利用出来ると
思います。
私も探してみましたが、見つかりませんでしたが、このファイルを落とした時の
２年前のホームページも一緒に落としていましたので、その指定先を試したら
今、落とせましたのでご利用できると思います。

ＭＳ社の説明では下記のように説明しています。
>>NEC製の PC-98シリーズ上で、いくつかのゲームでデジタルジョイスティック
>>(弊社 SideWinderシリーズなど)が正常に 動作しなくなるという障害がありました。
>>注意: この修正モジュールは NEC製 PC-98シリーズ日本語版DirectX 5.0専用です。
>>それ以外のバージョンの DirectXや AT互換機には使用しないでください。

下記の場所から落とせました。
vjoyd118.exe - http://download.jp.microsoft.com/directx/vjoyd118.exe
vjoydnew.exe - http://download.jp.microsoft.com/directx/vjoyd118.exe

レスありがとうございます。
上記ドライバーをダウンロードして使ってみましたが、認識してくれません(ToT)
やっぱりWaveStar上では、SideWinderシリーズしか動作しないのでしょうか・・・

NABEKINさん ご親切にどうもありがとうございました。
もうちょっとがんばってみたいと思います！

外してるかもしれませんが、うちでは「WaveStarのドライバ削除」→「再起動」→「WaveStarのドライバ組込」→「電源断」→「電源入」→「ゲームコントローラーでコントローラーの追加」。これを毎回やらないと認識してくれません。
使用機種はXv13/Wでプレステのコントローラーを変換器経由で使用していますが、これは関係ないと思います。かなり特殊(と言うか自分だけ?)な例だと思うので参考にならないかもしれませんけど。
WaveStarのドライバは最新バージョン(Aタイプ)、ROMはWST03です。