タワーなら内蔵とか（したいなー）
まぁ、せめて、どのＶ２００かだけでも。

さて。
古い９８でないとＦＤＤの端子は外に出てないので、Ｉ／Ｆも要るわけですが、ついてる外付けかしら？

その5インチソフトには2DDフォーマットのものはありますか？

　ソフトウェアメーカ側によっては、外付けFDDドライブでの動作を保証していないところもあります。実際は動作するものが多いようですが。
　また、HDDにインストールしてから使用するアプリケーションなら、1ドライブでも動作しますが、FDベースで動作するアプリケーションは2ドライブのものを用意しないと動作しないものもあります。
　外付けFDDドライブ及びインターフェイスボードのあてはあるのでしょうか。これらを考慮していないと、思っていた以上に手間や出費がかさんでしまう可能性があります。更にゲームが目的である場合FM音源ボードも必要になる可能性もあります。
　5インチドライブを（必要ならFM音源ボードも）内蔵したPC-9800シリーズを探した方が安くつく可能性もありますよ。

外付けのFDDは5インチ3.5インチ問わず、何かと手間がかかると思います。
目の前に「PC-9831MF2」っていう古くてデカイ、2ドライブ5インチユニットが
ありますが、ケーブルはフルピッチだの、FDDインターフェースは無いだので、
いまだに使えたことが無いです。

手元にFDDインターフェースボードがありますでしょうか?
※PC-9801-87等
コレが無いと何も始まりません。
私も5インチFDDが内蔵されている機種を選んだほうがよいかと思います。

あと、 http://www.me-hp.com/ というサイトにPC-9800シリーズの
全機種のデータを打ち込んだという気合の入ったエクセルデータがあります。
参考にして見てはいかがでしょうか?

Ｖ２００には外付けＦＤＤのコネクタがありません。
ＰＣ−９８０１−８７や、その互換品が必要になります。
このボードはオークションなら入手性がありますが、非常に高価です。

また、外付けＦＤＤのコネクタがある機種は、
９８０１シリーズのＦＡ・ＦＳ・ＦＸまでと、９８２１シリーズのＡｐ・Ａｓ・Ａｅ・Ａｆです。

外付けFDD I/F内蔵機種の多くは「2HD」のみの場合が多いので、手持ちが2DDの場合は
注意が必要です。(という意味で総額7650円氏が確認していると思われます)

その昔PC-9801UX21に外付け5.25インチドライブを付けていましたけど、2DD I/Fが
i80286では認識できずV30で立ち上げなければならなかったのが痛かった…… (V30
で立ち上げてからi80286に切換えればOKでしたが……)

外付け機器が動作対象外になるのは検査する工数が増えるからなどの要因があります。

プロテクトでも内蔵でしたらある程度ドライブ固定(数が少ない)ですが、外付けだと何が繰るかわからないなどで、オーバートラックなどの手法が使えなかったりするからです。

エプソンの３ドライブ実装機を探すてもあります。