>UIDE-98のBIOS設定をいじっていたところ
という事ですので、UIDE-98 BIOS 設定項目の I/O アドレスという事でしょうか？
デフォルトでは「自動」になっているハズですので、自動に設定すれば宜しいかと思いますが・・・
これが設定出来なくなったという事なのでしょうか？

メモリチェックしたところで止まってしまうのです。
BIOS設定まで進めません。

ＩＲＱやＲＯＭアドレスがバッティングした時の動きと似てますね。ＵＩＤＥ−９８のＢＩＯＳまで辿り付くのが目的となりますから
[ESC]+[9]+[HELP]しながら電源Ｏｎ(だったかな？)をした後、内蔵固定ディスクを[切り離す]に、２ｎｄＣＣＵを[使用しない]等 可能な限りのリソース開放を試してみては？
もちろんＵＩＤＥ−９８以外の拡張スロットに刺さっている板を外すのは基本ですけどね＞ゴミかも

ぽんさんの方法を試してみましたが、残念ながらうまくいきませんでした。が、
UIDE-98のROMを抜いた状態でPCIセットアップによりI/Oアドレスを指定、
その後、再びROMを取り付けて起動し、さらにBIOSの書き換えを行うことで
復活に成功しました。
でもWindowsを再起動するとUIDE-98のデバイスチェック時にフリーズする
（PnPがうまく機能していない？）現象が…。結局UIDE-98のセットアップは保留中です。

＞ぽんさんの方法を試してみましたが、残念ながらうまくいきませんでした。
ゴミレスで申し訳ありませんでした(u_u)

ゴミついでに…「UIDE-98のデバイスチェック時にフリーズする」ですが「PCISET」でUIDE-98の使用するリソースを固定しているとか？
もしそぅならUIDE-98が自動でリソースを確保するように仕向けて見るというのはどぅでしょう。要は選択肢を１つだけ残して他をＣバス用に予約してしまうとか 当方は この方式でＰＣＩモノ(UIDE-98,S2K32,USB2,NIC)を運用してます＞更にゴミかも

>UIDE-98のデバイスチェック時にフリーズする
何らかのデバイスとコンフリクトが起きているのでしょう。
マシンの拡張具合が分からないので何とも言えませんが、C-bus デバイスを装着していませんか？
PCI セットアップディスクで、そちらの IRQ を予約してみてください。

UIDE-98が空いている IRQ を自動的にシェアリングしてくれます。
あと、マニュアルに記載されていますが、UIDE-98の IRQ を固定にしてはダメです。