別に掃除機を使っても大丈夫ですが、それだけではあまり綺麗になりません。
掃除機と一緒に筆や歯ブラシなどを使って、くっついたホコリをはがしながら吸うようにすると、かなりきれいになります。
うちでは幅が2センチぐらいのペンキ用のハケをDIY店で買ってきて使ってます。あっというまに綺麗になりますよ。

＞マザ-ボ−ドのゴミ、ホコリなど掃除機で掃除してもさしつかえないのでしょうか？
掃除機で吸い取る場合、ジャンパピンなどに注意してください。ジャンパピンを吸い込まれてしまうと・・・大変です。

掃除機は弱にして、あっその前にゴミの袋は新にしましょう。万が一部品を吸い込んだときに探すのが楽です。筆は、ちょっと高いですが、油絵の具用の筆が毛足が長く腰も強いので綺麗にとれます。幅が1cmぐらいの平筆で、800円ぐらいです。
これで丁寧に掃き取って、少し離した掃除機で吸い込んでいく感じです。ついでに電源ユニットの埃、cpuフィンもこしょこしょとくすぐって綺麗にしましょう。

掃除機でバキュームしながらコンプレッサのエアでとばす。（屋内ではやめましょう）
掃除機で吹き出しの出来るのなかったけ？（今も有るのかな）

掃除機を御使用の場合は静電気に注意して下さいね。
空気とノズル（プラスティックの場合）の摩擦で結構静電気が起きますので。

みなさんレスありがとうございました。
でも少し静電気の事が気になりますが、今まで約3年間掃除した事ないので
明日掃除してみます。

掃除機も結構ですが、タジコのヤニは取り無いですから…
分解洗浄をするのが嫌なら、パソコンのある部屋は禁煙にしないとダメですね。
まぁ、パソコンを使い捨てにするつもりなら、禁煙の必要は無いのですが…

基盤用の静電対策されたクリーナーエアスプレーがあると思うので、
それを使ってふっとばすのはどうでしょう。
ただ、フツーのエアスプレーだと、噴射時に発生する静電気で電子部品
を破壊しかねないので（噴射時にはかなりの静電気が発生します）必ず
静電対策された専用のものを使ったほうがいいです。
ちなみに一般の掃除機って意外ときれいにできないのです(^^;（経験者語る）

状態にもよりますが、エアースプレーでもあまり綺麗にならないことがけっこうあります。
やはり、筆やブラシを使うのが一番です。