ドライバのインストールって事は、なにがしかのＯＳが立ち上がったって事でしょうか？
動作環境がはっきりしないので、何とも言えないんですが、
ドライバのインストールの際の様子や動作環境がくわしくわからないと、
アドバイスできないんですが…。

私はＸｔ１６／Ｒ１６を使っているんですが、ノーマルの状態でも、
ＨＤＤとＣＤ−ＲＷを取り外してＵＩＤＥ−６６につないだだけでは起動しませんでした。
内蔵固定ディスクインターフェイスを使用不可にして、はじめて立ち上がりました。
ドライバをインストールする以前の問題です。

このような例もあるという、参考までに…。

　ないと思うけどUIDE-66のBIOSが切ってあるとか、壊れてるのか。システムディスクを入れてくださいと出るなら、PCIセットアップディスクで、ボードが認識されているか調べてみるとか。
　あと花州さんの方法では本体のIDEケーブルをはずしてみてください。

HDDを繋ぐと、IRQを使用するようになりますので、IRQの競合（というか他のデバイスとのシェア）が発生して起動できないんだと思います。とりあえずはUIDE-66を別のスロットをに入れる、[ESC][HELP][9]起動をした後に要らないデバイスを使用不可にしてIRQの空き作る、などの対策でしょう。これは下のスレッド#36760にも言えます。

みなさんありがとうございます。皆さんに教えて頂いた通り要らないデバイスを使用不可にしたりもしてみましたが、どうもうまくいきません。ＰＣＩセットアップディスクも試しましたが、きちんと認識しているみたいですし、ＩＲＱ潰してＨＤＤつないでもシステムディスクを入れろと言われるし、ＵＩＤＥ−６６に何もつけない状態だときちんと見た限り認識してるし、ＷＩＮ９８も起動してくれるのですが・・・・・

確認ですが、現状では、UIDE-66以外のハードディスク（内蔵IDE？）からWindows98が起動できているのですよね？。その場合、
＞システムディスクを入れろ
このメッセージが出るというのは不思議です。なぜか内蔵IDEの認識のほうもおかしくなっているように思われます。UIDE-66がIRQ 9を使用しようとしていたりしませんか。
＞ＰＣＩセットアップディスクも試しました
試すだけであって、絶対にUIDE-66のリソースを固定に設定しないで下さい。

今いろいろ試していて気がついたのですが、起動時の画面を見る限りどうもボード（ＵＩＤＥ−６６）に接続した機器を認識していないようです。つないだはずのＨＤＤやＣＤ−ＲＯＭの型番が、表示されません。何回も試しているのですが・・・・あと見た限りではＵＩＤＥ−６６のＩＲＱは最初に差した時から６のままです。とくにＩＲＱ９を使おうとしているようには見えません。

UIDE-66のBIOS設定を見直して下さい。マシン起動中にCTRL+GRPH+Zを押していると現われます。

CD-ROMのマスタ／スレーブの設定を変更せずに、そのままHDDと同じプライマリに接続
したとか？

32GB以上のＨＤＤをつなげようとしているとか？
昨日40GBのＨＤＤを買って、同じ症状で悩みましたので・・・
（ＨＤＤ側で32GBになる？ようにジャンパ設定するとＯＫでした。）

HDDを、98が起動した後に、後刺ししてみたらどうでしょうか・・・。

私も同じ症状で悩みました。
それまでUIDE-98で使用していた機器も、新品のドライブもまったく認識しなくて、メーカーに問い合わせたところ交換してもらえるということでした。
まだ帰ってきてないんですが。

皆さんありがとうございます。急な出張でレスをみるのが遅くなりまして申し訳ありません。ＵＩＤＥ−６６の設定は工場出荷時のままであることを確認しました。私が今繋げようとしているのはとりあえず２ギガの起動ドライブのみです。他の物は今のところ取り付けていません。あとはメーカーに問い合わせか、もしくはＩＤＥはあきらめてＳＣＳＩにするしかないのでしょうか？

＞２ギガの起動ドライブ
かなり古いドライブではありませんか。UDMAに対応していない（少なくとも UATA33も怪しい）のではないかと思うので、UIDE-66の BIOS画面で、転送速度を PIO4あるいは DMA0などに設定してみて下さい。あと、もしかしてウェスタンディジタル製のドライブならば、マスター単独と、スレーブ存在のマスターとは、ドライブの設定が異なりますので注意して下さい。

すばやいレスありがとうございます。ＨＤＤはウェスタンの物１台だけですので、シングル設定にしてあります。それとＵＩＤＥ−６６のＢＩＯＳでの設定変更ですが、繋いでも機器を認識してくれないので手が付けられない状態です。

UIDE-66の BIOS設定は、HDDを繋ぐ前にやっておきます。

アドバイスを下さった皆さんありがとうございます。おかげでやっと動作しました。ＵＩＤＥ−６６のＢＩＯＳのリムールバブル設定を変更したら動きました。助けて頂いた皆様に心よりお礼申し上げます。本当にありがとうございました。