うちではＰＣ9821Ｖ20Ｍ7でＵＳＢ増設ボードのＵＣＩ-Ｐ2（ＢＵＦＦＡＬＯ）を使ってＳＨＡＲＰのＪＸ230っていうスキャナーが動いてます、
動作は問題なしです
参考までに

追加
ＯＳはＷＩＮ98ＳＥです。

SCSI接続のSCANERをPnPで使うために、V200SZDのPCカードスロットにCBSC2を16bitモードで入れて使っていました。現在は Changpon(綴りあってる？）のUSBポートにGT7000を接続しています。　9821の場合は本体USBより増設カード上の方が動作確立高いのではないでしょうか。

＞zafさん
Xa16/R12にUSBは付いてませんよ（汗）

本題の方ですが、ウチではSC-UPCIにEPSONのGT-7000Sでなんの問題なく動作しています。OSはWin98SEです。費用はかかりますがSCSIの方がいろいろラクなのでは？ただ、PCIスロットが空いているのならUSBの方が安価に付けられると思います。

>鷹駆 さんコメントどうもです
　標準装備のUSBでなければ動作しないという点を心配されていたようですんで
後付USBでも問題ないと思いますよ、という意図でした　*(. .)*
　私も最初はSCANERもSCSIが好き(USBはやっぱり遅い）だったのですが、MO,CDRと
増殖し、HDDがULTRA-SCSIになったたため、ケーブル長の問題から泣く泣くあきら
めたのです．．

以前はAHA-2940にマステックのFJS-1200IIIを繋いで（今はIOのSC-NBUNAでAT機に繋いでる）使ってました。SCSI接続ならば大抵のSCSIカードで動くと思いますが、Canonの奴はフィルムスキャナですが、FS2710はSC-UPCIじゃあ認識されるけど取り込みできませんでした。

僕のトコでは、ＰＣ９８２１Ｘｖ２０／Ｗ３０、Ｗｉｎ９８ＳＥで、増設ＵＳＢがメルコの
ＵＣＩ２−Ｐ２、スキャナーがＣａｎｏｎのＣａｎｏＳｃａｎ　Ｄ２４００ＵＦですが、
無事動いてます。ドライバのインストールも問題無くできました。
しかし、このスキャナーのせいかどうかの確証はないですが、なんかスキャナー導入後から
よく固まるようになりました(^^;

PC-98で正式に動作保証があることと元々USBを備えていないことに加え、ある程度以上の大きな画像データの転送速度を考えるとEPSONのSCSI接続のスキャナをおすすめします。実家のXv13/W16（SCSIインターフェースはSC-UPCI）でGT-8700、手元のRv20（オンボードのUltraSCSIインターフェース）でGT-9600を使っていますが、どちらも問題なく動いています。GT-8700はSCSIとUSBの両方のインターフェースに対応しており、価格も2万円を切るところまで下がっているのに加えスキャニングのスピードがかなり高速な部類に入るのでなかなかおすすめです。

GT-9600は3年近く前の古いスキャナですが、かつてのプロユース用な製品だけあって速度的にはGT-8700に匹敵するものがあると感じました。ただ光学解像度が800dpi止まりな点とインターフェースがSCSI-2に限定される点ではGT-8700に劣っています。

私もEPSONのSCSI接続のスキャナをおすすめします。私は2940にGT-9500で使っていますが特に不満はありません。転送速度からいえばＣバスでもいいでしょうが相性がちらほらあるようなので空きがあればPCIをお勧めします。
それと、EPSONでWIN2000非対応になっているスキャナーは、SCSI１の速度しかないそうです。逆にこれらはＣバスで充分かと。
一度、友人の8700と自分の9500を比べましたが速度では8700、絵の綺麗さでは9500のほうが上でした。スキャンする絵柄にもよりますが、参考まで。

Xa13/KでGT-7600Sを以下のＩ／Ｆで接続し、それぞれ無事動作しました。スキャナなら貴重なＰＣＩを潰さずともＣバスＳＣＳＩで充分かと・・・ただ、入手しやすいＩＦＣ−ＮＮは未検証ですが、非対応のようです。
☆検証済みＨ／Ａ
メルコ　ＩＦＣ−ＵＰ，ＵＳＰ，ＷＳＰ（全てＰＣＩ）
アイ・オー　ＳＣ−98IIIＰ（Ｃバス）

EPSONがWin2000非対応と言っているスキャナ（GT-9000等）は
実際にRa20+SC-UPCIで強引にWin2000/WinNT4.0用ドライバを入れて試しても
正しくスキャンできないので
（カラーでは横が1/3につぶれ、３原色がバラバラになる。モノクロならば正しくスキャンできるが）
やめておいた方がいいです。

私はパラレル接続の安物　ＮＥＯＳ　ＮＳＦ−６３０Ｐ２　を　使っています。
＞パラレルはプリンターで使用中
＞（プリンターには追加のパラレル用の
＞インターフェースは付いていません）
ＰＣ本体＝＝＞スキャナ−＝＝＞プリンタ　という形でつなぐようにできています。

私もスキャナ接続していますが、以下の接続で問題なく動いています。
PC9821V12S5RA→IFC-NN→DSC UE6.4GB(HDD)→GT-8700
スキャンする時も特に色がおかしいとか、画像がつぶれるとかいった問題は
発生していません。参考までに書かせて頂きました。

皆さん情報ありがとうございました。
SCSI接続なら問題も無いようですね。
増設USBボードからの接続でもちゃんと作動している機種もあるようですね。
（Sharp JX-230やCanon canoscan D2400FなどのパンフレットにはPC9800/9821
　シリーズでは動作(対応）しませんと書かれています）

とりあえずUSBボードを購入してみます。（買っても無駄にはならないでしょう）
本当にありがとうございました。

USB接続でしたら上で書いたようにGT-8700を推しておきます。EPSONならではのプレビューの速さははっきり言って快感です（笑）。ただCISタイプではなくCCDタイプなので薄型のスキャナに比べるとかさばりますが・・・。

わたしもパラレル接続で使ってます。
ＮＥＯＳはＡＴ／９８どちらも保証していてよかったんですが、
残念ながら、カタログ落ちですね。
今なら、ＳＣＳＩかＵＳＢ、速さを取るか、扱いやすさを取るかでしょう。

もう見ておられないかもしれませんが参考まで。
PC-9821Xv13/R16改にCHANPONボードという構成で、CHANPONボードのUSBコネクタにELECOMのUSBハブ、UH-M4SGTをセルフパワードで接続し、その先にCanonのUSBスキャナ、Canoscan N1220Uをつないでいます。当然対応外ですが正常動作しています。