SCSIカードなどもう少し情報を書いてもらわなければ具体的なアドバイスはできません
おそらくSCSIボードのマニュアルかドライバの入ったFDの中に説明があるでしょう

私も一度９５にもどしました、そのときは９５起動デスクでアタピーのｃｄは認識しました。
スカジーの場合は、一度MSDOSで認識させて９５をインストールした記憶があります。

SCSIにBIOSが搭載されていれば、BIOS画面からきちんと認識されているか確認してください。
搭載されていない場合、DOSの場合、ASPI経由で認識させることが可能です。
この場合、SCSIボードの説明書を参照してください。
Windows95の場合、特に何もしなくてもCD-ROMドライブは認識されると思いますが。
#Windows95の場合、スタンダード版はFD版しか存在しないのでね。

ＳＣＳＩ　Ｈ／Ａに附属のＡＳＰＩマネージャとＣＤ−ＲＯＭに附属のリアルモード用ドライバ（ＰＣ-98用）が必要になります。リアルモードドライバが無い場合はＨ／Ａに汎用ドライバが附属してるかもしれませんし、Ｖｅｃｔｏｒにもあるようです。過去ログも見てくださいね。

追記：Ｗｉｎ９５起動ディスクのＣＯＮＦＩＧに上記ＡＳＰＩマネージャとリアルモードドライバを組み込む必要があります。Ｗｉｎ９５製品版の場合はマスターディスクにではなく、「アプリケーションの追加と削除」で作成したディスクに組み込むのが安全でしょう。Ｗｉｎ９８の起動ディスクがあればもっと楽。（Ｗｉｎ９５起動ディスクでフォーマットしたあとに、Ｗｉｎ９８起動ディスクでＣＤ−ＲＯＭを認識させ、ＣＡＢファイルをＨＤに転送して、ＨＤから起動してセットアップ）

ところで、HDDを初期化したぐらいでCD-ROMドライブを認識しなくなることなんてあるのでしょうか？、なんて聞いてみたりして。

私は、Xa10をオールSCSI化して９５，９８と使ってますが、別に問題なくCD-ROMも認識できます。
既に先輩諸氏が書かれているとおり、純MS-DOSで認識させるためにASPIドライバを組み込んでドライブにあったmscdexを選択すればちゃんと動きます。
まして、WIN98上で認識できていたSCSIドライブなら、MS-DOSでもOKです。
過去ログに、たくさん事例があります。

SCSI接続のHDDの場合はSCSIとつながっていればHDDとして認識しますがCD-ROMドライブの場合はCONFIGとAUTOEXECにドライバが必要です。CONFIGとAUTOEXECの中を見て下さい。このへんはマニュアルにも書いてあると思いますが。

えー、僭越ですが、未だにＤＯＳ現役で使用していますので一言
ＣＤドライブを認識しない、との事なので、少し整理して書きます

ＳＣＳＩ Ｈ／ＡにはＢＩＯＳが乗っていて、
起動時にＳＣＳＩのＢＩＯＳ読み込み画面がメモリチェックの後
表示され、そこでＣＤドライブが認識されているものとして話します

ＡＳＰＩマネージャ、と皆様書かれておりますが
基本的にＢＩＯＳで認識されているドライブであれば
ＣＤドライブに付属のドライバ、もしくは汎用ドライバの組み込みで
問題なく使用できます
＃記述方や使用法は取り説やメーカーのＨＰや汎用ドライバの解説で調べて下さい

ＢＩＯＳが乗っていない、起動時にＢＩＯＳ読み込みが表示されないものであれば
皆様がおっしゃるようにＳＣＳＩボード付属のＡＳＰＩのドライバと
ＣＤドライブ付属のドライバ両方を組み込む必要があります
＃これも汎用ドライバは存在したハズです

と言うか、これはホントに過去ログにわんさか乗ってる話だと思います（＾＾；
一度検索されてみては？

しつこいかもしれませんが、ハードウェア的に認識されないのか、
ソフトウェア的に認識されないのか書いてくれないとみなさんの回答が無駄になってしまう
かもしれませんので、もっと詳しい状況を書いていただきたいものです。
#つーより、何らかの反応があってもいいんじゃない？

＞基本的にＢＩＯＳで認識されているドライブであれば
これはSCSIボードによるのでは?
BIOSで認識されていても付属のASPIマネージャを組み込むようにマニュアルに記載されているボードはありますから、、
あと、SCSIのBIOSが載っていないボードで使えるASPIマネージャですがPCカードの物は付属していますがPCIやCバスのボードでDOS用ASPIマネージャの付いているボードは有りますかね？

BIOSのデキが悪いために、CD-ROM関係のBIOSファンクションをサポートしていないモノがあり、そのような製品では、
＞付属のASPIマネージャを組み込むようにマニュアルに記載
ということがあるのかもしれません。しかし、メルコ・アイオー・ロジテックといった老舗の製品に添付のCD-ROMドライバは、BIOS内ルーチン使用のものです（ASPI使用との切り替えもできる）。
＞PCIやCバスのボードでDOS用ASPIマネージャの付いているボードは
RatocのREX PCI30とか…。Q-Vison製ので、Western Digital のチップが載ったSCSIカードも、ASPI経由でのみ9821で使用可能だったりしました(BOOT可能なBIOSなし)。

再セットアップで手一杯なのかもしれませんが、何か反応してくれませんか？＞しゅうさん
このままスレッドが流れてしまうと、後で見る人には何の役にも立ちませんし、元の質問の内容が不充分なのにも関わらず手探りで回答しているみなさんに失礼ですよ。

もしかしてDOSが全然わからないので皆さんの言っていることが半分も理解できていないとか？。

まぁ、こんなに速く回答が有り、スレッドの流れるのが早いと言う事が解っていない場合もありますから初回の投稿は大目に見てあげても良いのでは？
何度も質問している人なら別ですけどね。

＞まりもさん
ほう、BIOS非搭載で起動可能なボードが有るのですか、勉強になります。
・・・BIOS読み込み無しでASPIは何処から読み込むのかちょっと不思議な気がしますが、、

「起動可能」とは書いてません。DOS-ASPIが「使用可能」ではありますが。ASPIプログラムがSCSIチップを直接コントロールすれば、BIOS内ルーチンは不要です。そのようなASPIマネージャは、常駐サイズが異様に大きいので、BIOS依存型とは区別つきます。

＞「起動可能」とは書いてません。
え？だって「BOOT可能なBIOSなし」って書かれてますけど(汗)、
BOOTって「PCを起動する事」と言うのが普通に使われると思っていましたけど違うんですかね?

"BOOT可能なBIOS"なし...ですね（汗

↑ちょっと険悪な雰囲気になってきたのでフォローを・・（でしゃばり？
ＫＯ１さん＞
　まりもさんは、Q-VisonのＨ／ＡがＡＳＰＩマネージャ経由だとＰＣ-98でも使えるが、それにはＰＣ−９８でブート可能なＢＩＯＳが載ってないということをおっしゃりたいんじゃないかと思うんですが・・・

　ところで、ＤＯＳ用（というか、リアルモード用）ＡＳＰＩマネージャですが、メルコのＩＦＣ−ＵＰ，ＵＳＰ，ＷＳＰ、アイ・オーのＳＣ−ＵＰＵ２ともに附属していたので、起動ディスクのＣＯＮＦＩＧをいじって組み込んで使っています。ＭＳ−ＤＯＳ６ではこれにＭＯバも使うので必須です。以前メルコのＣＤ−ＲＯＭドライブ（中身はパイオニアのＤＲ−Ｕ０６Ｓ）に附属のＤＯＳ用ドライバにはＡＳＰＩマネージャ不要のＰＣ−98専用ドライバとＡＳＰＩマネージャが必要な９８／ＡＴ両用ドライバの２種類が同梱されていました。ＭＯも使うのでＡＳＰＩが必要なほうのドライバほ使っています。

普通に読めば"BOOT可能なBIOS""なし" と理解できるところを、わざわざ、"BOOT可能で""BIOSなし" などという、どう考えても可能性の低い方向に、わざわざこじつけて難癖をつけたいということのようですね。そういう人がいるということは、肝に銘じておきましょう。

え゛、こじつけじゃなく本気でBIOS非搭載なBOOT可能ボードなのかと思ってしまいました(汗)。
だから不思議って書いたんですが意味を取り違えていたとは(恥)
失礼しました。

ゴミです。
この、スレッド、土曜日に見つけ、既に突っ込みＲＥＳされていたので、
合えて、それ以上、細かい突っ込み書かないでも、良いかと思いましたが、
これのスレッド、このペースだと、流れてしまいますね。

しゅうさん見ています？。回答得られずに終わりますよ。