Windows2000自体のインストールには問題はないと思いますよ。
K6-2に乗せかえるのですよね？
できればK6-III(or+)がお勧めです。
以前Xa7にWindows2000をインストールしていた頃がありました。
Win98よりも体感速度が上がるかもしれません。

もちろんハードディスクの増設は必須ですよ。
最低800MB以上食うはずです。

それほど無理なスペックではないと思いますよ。
うちではXa13/W12、K6-2/300、メモリ32MB、内蔵IDE 1.2GBで
Windows2000をインストールしました。
32MBではさすがに泥の中を歩くような重さの上に、
OS以外はエディタくらいしか入れられませんでしたが・・・。
メモリ72MBもあれば、普通に使えると思います。

よかったー
みなさまありがとうございます
早速買ってきて(Windows2k)インストールと格闘してみます
以前NTを入れていた事があったのですが、何も知らなかったので随分苦労した思い出がありますので・・・

Xc13/M7(K6-III500MHz、メモリ128MB)とXv13/W16(K6−III400MHz、メモリ128MB)でそれぞれWindows2000ServerとWindows2000Professionalを運用していますが、どちらも起動直後にメモリを50MB程度使っているようです(Serverのほうはそこまで削った、ですが)。快適に使う、となると本当はあとメモリが必要になってくると思います。CPU的には自分のところよりもっと低くても大丈夫そうですよん。
Xv13/W16の方はSCSI Onlyにより、さらに快適、という感じです。意外に使い勝手いいです、Windwos2000。

Windwos2000はプラグ＆プレイがしっかりしているでNTよりも楽ですよ。

PC-9821Xa9にWin2Kをインストール、参考になればと思い結果報告します
（Win2Kはアップグレードバージョンです）
インストールの初期段階でつまずきました
セットアップ起動ディスクを作成してからクリーンインストールを試みました

MS-DOSから起動ディスク4枚を作り、セットアップディスク1をFDDに入れて電源を入れました
正常に4枚目まで読み、大容量記憶装置の検出まできましたが、CD-ROMドライブの検出ができません。

対策
WinNT4.0WSをまずインストールして次にWin2kにアップグレードする方法を行いました
IDE CD-ROMの認識は何事もなく通過しました

エラー 0x0000007B が発生
ウイルス関連かと思いましたがその前に増設したボード類を取り外しました
(PCIのLANボード・CバスのPCカード増設アダプタ・CバスのSCSIボード)
無事通過、これでインストールだけはできましたが・・

一度リセットしないとOSが立ち上がらない
一応Win2Kはインストールできましたが問題発生
電源入れて固定ディスク起動メニュープログラムまで進み、OSを選択した後真っ黒で固まってしまいます。
この時リセットボタンを押すと、最初からスタートしますがOS選択後もうまく起動できます。
その後この問題は自然に解消されました

それ以外でも不都合が色々出てきました
まずドライバがまだWin2K対応になっていない
LogitecのCバスSCSI i/f LHA-301(前時代の遺物になるか！）
LogitecのMO LMO-400(これも前時代の遺物になるか！）
PCMCIA IDE/ATAPI
SP1を入れましたが状況変らず IRQ不足でトラブル ん〜わからない

善くなった事
ネットワークに接続したコンピュータを認識するまで大変時間がかかったが
Win2Kは立ち上がりからほとんど気にしなくてもよくなった。

質問です
セットアップ起動ディスクからクリーンインストールする時
[IDE CD-ROM (ATAPI)/IDE Controller]を認識しないのはなぜ ？
Win2kを再インストールする度に増設ボード類を取り外さなくてもいい方法は ？
PCカードが使えないので対策は？

いっぱい書きました、すみません。