Win98をある程度快適に使うとなると、結構お金が掛かってしまうと思います。
どのくらいの予算までだったらいいのかが判った方がアドバイスしやすいと思います。

ＰＣＩの使い方でだいぶ異なります。ふつうのＸａ７はＰＣＩ２本だったと思いますが、ここになにを差すのかを決めるとよいかと思います。
たぶん現在増設されているＣＤＲがＡＴＡＰＩ（もしくはＣバスＳＣＳＩ）であることを前提にしていっているのですが、基本性能の向上を目指されているようですので、少なくともストレージのＩ／Ｆを入れるのが速度的に効果が高いです。パフォーマンスからみればＵＩＤＥ−６６（＋３２Ｇ以下のＡＴＡ６６ＨＤＤ）をお奨めします。これでまとめて２万円前後です。ＣＤＲがＳＣＳＩである場合、使っているＳＣＳＩボードによってはＳＣＳＩＨＤＤかＡＥＣなどの変換＋ＡＴＡ６６ＨＤＤというのも同等（速度的にはやや劣る）金額になります。
ＣＰＵは金額と目的次第です。最新に少しでも近づけるとなるとメルコしか選択はありません。とりあえずなら、中古で適当なＣＰＵをあさって、直乗せジャンパいじりか下駄となります。こうなると金額はピンきりです（３ｋ〜４０ｋ）

そうですね、Ｃ４だとジャンパ弄るとパリティいりますし、結構かかるかも・・・・
HDDそのままってまさか、４００？しかもコーナー？
私は昔パワーアップしようとして、結局あきらめました（V200に逃げました）
言ってしまうと元も子もないですが（禁句？）、新しいの買えます・・・・
上記HDD系で３万弱、ベース弄らずにアクセラレーターとかで２万？（K6-2-500or
K6-3-400）、さらにGAで２万ぐらい？（savage系かな）、メモリ６４にして0.5万
OSに１万？　これぐらいすればWIN98が快適に動くと思いますが・・・・・・
　WIN98・・・、親にXA7/C4をメモリ40に増やしただけで一太郎とか使わせてたっけ
積算根拠は結構いい加減なので、その辺のところはよろしくお願いします。
　

Xa9,Xa13を持ってますが、ゲームをやるなら、グラフィックアクセラレータは必須です。
voodooBanshee(20K)かSAVARAGE-PROを待つ、
もう１つのpciは、これが難しいのですが、all-SCSIでいくならSCSIカード、
ideの66なんかも拡張機器がないならいいかもしれません
HD速度を犠牲にするならusbカードを差す手もあります。

まあ上のかたがたと意見は同じで割があわないです。
無改造でメインマシンはきついですが、
CPUk6-2 300(5000円) とメモリ６４m(１.2万円)の追加で
インターネット端末にはなれますが。

Xa10をメインに使ってますが、お金を10万円以上かけても最新機種とは比べられませんので…やっぱり割には合わないと思いますよ。
参考までに、僕はK6-III400MHzとN2ゲタで10K〜15K、SC-UPCIで6K、VoodooBansheeで20K、AtlasV18Gで33K、MEM32x2で20Kというふうに合計7万円位かけてますし、それにMOやらスキャナーなどで実質10万円なんかで済んでませんし…たしかにWin98は快適ですが。

こんにちは！

資産を後世に引き継ぐならばHDD増設は有効な手段ですねっ！
AT互換機だったりPC9821X,V,Rの後期ものに移行しても使えますから。
PC9821のPCI増設ものならUIDE66(ATA66)やIFC-USP-M2(SCSI)が現行品ですね。
これに数十GBクラスのIDE-HDDで結構快適になるのでは？

後は、用途で強化ポイントを決めてみては如何ですか？
私は、Direct3Dなゲームがやりたくてビデオ＆サウンドを強化しました。
Xv13/Rをベースに強化しましたが、結局５万位かかってます。
これくらい出せれば、もっと速い中古PC9821が買える気がします(^-^;
たぶん・・・