ＨＤＤや２３０ＭＯについては，ＣＤ−ＲＯＭ等のようなデバイスドライバを特に必要としないので，ＳＣ−９８IIIのドライバがあれば問題ないでしょう。（ＢＩＯＳ搭載のＳＣＳＩボードであれば，接続するだけでＤＯＳ上での動作すら可能です。）但し，６４０ＭＯの場合にはもしかすると必要になるかもしれません。ただ，システムＣＤを無くした状態で現行ＰＣを運用するのはＯＳのクラッシュが予想されるＰＣでは余り好ましい事とは言えませんので，ＰＣを破棄処分でもしない限り極力サポート等に連絡されシステムＣＤを請求し直すのがいいでしょう。再インストールの時，ライセンス等の面倒な問題が発生しますので。

128/230/540MBメディアの場合、PC-98ではハードで勝手に認識してくれます。
640MBメディアの場合、Windows95ではデバイスドライバが必要になります。

ただしSCSI-IDは連続させないと、dosで見えないときがあります。
あと９８モードを備えてたMoがありましたが、あれはどういう影響があるか
ご存知のかたいますか？

98モードのあるMOドライブというのは、かなり昔の製品だけでしょうね。
HD互換モードに設定した状態でもNECチェックのあるSCSIアダプタに
拒否されないよう、ドライブ名の先頭3文字を"NEC"にするモードと思われます。
例えば FUJITSU M2512A が NECITSU M2512Aという風に変わります。

なるほど。NEC以外のscsiボード製品はおそらくそんなチェックいれないだろうから、
OKですね。AT互換機で使う場合スイッチいれても影響ないということになりますね。マニュアルに従うのが無難ですが。