以前の内蔵ディスクの内容を、UIDE-66に接続したディスクに丸ごとコピーするのではダメですか。

いえ、それなんですがね
今はそれでやってるんですよ。
で、今後再インストールする場合はどうしようかなって
古いHDは違うところに持っていく予定で
答えてくれてありがとうでした

２０ＧＢという大容量にモノを言わせてＡドライブのバックアップを取るのが一番理想的、かつ現実的だと思います。ＤＯＳの知識はおありでしょうか？　おありでしたら、まりもさんのＨＰにある「ＤＲＶＣＰＹ」を使えばＤＯＳからドライブごと丸ごとバックアップ可能です。
復元するときも、バックアップＣＤから戻すよりは圧倒的に速いはずですし。
ソフトの在処は過去ログですぐに出てきます。

ウチのXv13/W16の場合、UIDE-66ではなくUIDE-98（M相当）なのですが、Windows98で作った起動ディスクがあればUIDE接続のHDDも普通に見えます。とりあえずWindows98（95だとOSR2以降しかFAT32が認識できないので×）で起動ディスクを作り、それにUIDE付属のDOS用CD-ROMドライバをコピーしておき、UIDE接続のCD-ROMも見えるようにCONFIG.SYSとAUTOEXEC.BATを書き換えておけばOKかと思います（ウチではこれでまっさらなUIDE接続のHDDとCDオンリーで再インストできてます）。

ただ、このやり方では全手動（汗）でのセットアップになってしまいますが・・・・(^^;;

＞全手動
V200の型番が解らないので断言出来ませんが、V200S7C3+IFC-USP-M2ではカスタムセットアップでもほとんど標準と変わらずにインストール出来ます。＜HDDのフォーマット設定くらい

物理的なクラッシュに備えてのバックアップであれば、きとさんのおっしゃる「丸ごとバックアップ」は、物理的に別の媒体（別のＨＤ、ＭＯなど）にすべきですね。
ソフト的な問題を解決するための再インストールであれば、デンドロビウム さんの方法がスマートです。UIDE用のCD-ROMドライバを組み込む作業が面倒な場合は、CD-ROMの中身を（それこそ２０ＧＢの容量を生かして）ＨＤのどこかのパーティションにコピーしておくという手もあります。
ただしアプリ込みのバックアップＣＤからの再インストールの場合は、環境チェック（機種によりさまざま）に引っかかる場合の対策も考えておく必要がありますね。

Windows95 OSR2のいわゆるCABセットアップでは機種固有のデバイス使用できるようにならなかったりということがあるので、インストールＦＤを使ってきちんとセットアップしたほうがよいと思います。そしてセットアップした状態をバックアップ保存しておいたほうがよいでしょう。

みなさん色々とありがとうございました
とりあえず古いHDに再インストールして
それをソフトでバックアップしてDPTAの方に入れておきました。
これで何とかなりそうなので今のところこの方法にしておきますね

　もう見られることは、無いかもしれませんが、システムインストールディスク（FD）のコピーを取りAUTOEXEC.BAT内の、98CHECKを削除すれば目的のことが出きると思います。

　UIDE-66にCDドライブを接続されている場合、それに応じてFDの書き換えが必要となりますがその辺は過去ログにて何度も話題に上っていることですし、簡単に調べることが出きると思います。

＞V200S7C3+IFC-USP-M2ではカスタムセットアップ・・・
　私が実験した限り、IDEHDDが標準IDEポートに接続されていない環境でSCSIHDD（含SDAT）にはどうがんばってもシステムインストールディスクを用いたWin95のリカバリは出来ません。どのようにされているのでしょうか？