早速試してみましたが・・・
今まではAEC-6260のWin2000用ドライバを使用していましたが特に違いはなくベンチ的も同じでした。
IBM-DTLA-307020 Read/Write=34132/40959(HDBENCH 2.610)

尚、説明にも書いてますがWindows2000では起動ドライブをいきなり繋いでも既にUIDE-66用のドライバが組み込まれていなければ起動できません。
標準IDEで認識できる容量であればUIDE-66に何も接続しない状態でセットし標準IDEから起動して認識させドライバを組み込めば良いのですが、標準IDEでは使えない大容量HDDをUIDE-98で使用していた場合は一時的にGA等を抜いて２枚挿しする必要があります。（ちょっとめんどうですね）　また、２枚挿しした時UIDE-66のBIOSが勝ってしまう場合はUIDE-98から起動できなくなるのでこの場合は一時的にUIDE-66のBIOSを無効にする必要があります。
PCIが１本の機種ではこれができないのでちょっと厳しいですね・・・

>PCIが１本の機種ではこれができないのでちょっと厳しいですね・・・

そういう場合は、インストールし直すことで回避できます。
セットアップの最初にドライバを組み込むことができ、
インストールする事ができます。

V166S5C流れ星+UIDE-66+DPTA37020