Anに内蔵可能な IDE HDDの最大容量は、4.3GBで、CD-ROMは SCSIタイプ以外は使えません。
また、ファイルスロット仕様の CD-ROMドライブは入手が困難なので、基本的に外づけになります。
あと、An用の FDDは、型番 FD-1138Tまたは、FD-1148Tが使えます。
V200の増設 FDDは型番が、上記と同じであれば使えますが、
おそらく違うので、使えないと思います。

http://www.amy.hi-ho.ne.jp/nakajima-jr/

V200用のFDDはFD1231Tなので、Anには使えません。

Ｖ２００のＦＤＤは、制御ケーブルが３４Ｐ＋電源３Ｐです。
Ａｎ内蔵のＦＤＤは、制御ケーブルが２６Ｐ（電源含む）です。
そのままでは、接続できません。
もちろん、取り付け寸法も違います。
もちろん、取り付け寸法も違います。
まぁ、電気的には変換ケーブルを作成すれば使えるような気もするのですが…

また、ファイルスロット専用のＣＤ−ＲＯＭドライブを使用するには、Ａメイト専用のＳＣＳＩインターフェースボードが必要です。
また、その場合には、Ａメイト専用の篭に入ったＳＣＳＩのＨＤＤも使用できます。
ただし、ＳＣＳＩのＨＤＤの容量制限は（私は）知りません。

どんな機種で、FDDを流用できるのでしょうか？

Ae,As,Ap,As2,Ap2,Xe,Xs,Xp,Xnなどでしょうか・・・・。

＜内蔵のIDEに接続できるHDDの最大容量

の補足。
BIOSによっては540MBで壁がある場合があります。
その場合は、BIOSをアップデートすることにより上限を4.3Gにすることが出来ます。

＞どんな機種で、FDDを流用できるのでしょうか？
そのほかの機種としては、
ＰＣ−９８０１のＢシリーズでＢＸ４以外の全部
ＰＣ−９８２１のＢシリーズ全部
この辺なら、間違いなく使用できます。
他にも、初代Ｘａとか初代ＸｔとかＣａｎＢｅの一部とかもありますが、
複雑ですから、そちらの方は手を出さないほうが賢明だと思います。

http://www.tokyo-green.ne.jp/98fdd/index.html
ここに、そのような関係の資料があります。ただし変換アダプタの製作はひじょうに面倒で、危険もともないますのでおすすめしません。BIOSのほうはベクターあたりに限界を突破するソフトがあったはずです（それでも４．３Gまでしかできませんが）。検索をかけてみるといいと思います。

>他にも、初代Ｘａとか初代ＸｔとかＣａｎＢｅの一部とかもありますが、

Canbeシリーズは軒並み34ピンタイプのFDDでAnに流用不可なんですけど・・・

どうやらとんでもない勘違いをしていたようです。
As2/U2でした。An2は存在しないようです。