ええと、質問の答には、なってませんが、
@nifty FCYRIXの、V33FANさん作のツールは、バージョンアップされては、いないのでしょうか?
ワタシは会員でないので、確かめようがありませんが、、、
んで、
ほかに心当たりのあるツールといえば、HSBです。
Windows95で、倍率を設定後、HSBによる高速再起動で、Windows2000を立ち上げれば、先に設定した逓倍率で、起動することでしょう。
また、
お持ちのC3が、Ezraコアであり、高倍率での固定運用が可なのであれば、
CyrixIII/C3関連の著名なサイト
http://isweb13.infoseek.co.jp/computer/cz600c/ にて、<ブリッジによる倍率変更>を、参照されることを、お奨めします。
当該ページの、2番と4番を各々shortさせると、12倍設定となります。
なお、566MHz近辺より高い周波数だと、K6-2パッチ無しには、Windows95が、起動しなくなります、、、