DOS画面が出なくなってしまったようですね。[GRPH]+[2](フルキー)にて回避出来ると思います。
この症状はわりとFAQなので、過去ログやトップページから行ける「PC-98問答集」にも記載が有りますのでまずは調べてみて下さいね。
http://www.griffonworks.homeip.net/dorcom_qna/html/qna_79.html恐らくMS600Pを導入したことにより一時的に24kHz出力になってしまったのでしょう。位相の微調整が必要かもしれませんね。
ちなみにキャッシュコントローラーは関係ないと思います。また製品添付のものよりも、まりもさん作のK6WAWCのほうがいいかもしれません。