どのような使用目的で、どの程度のお金を出せるか書いていただければ、具体的なアドバイスをできるかとは思いますが、すべてにおいて、ストレスなくいまどきのパソコンに引けを取らないなんてふうにしたいとか言われたら、自作機が作れますよ。
とりあえず、何がしたいのかを書いてください。

あとは、改造というものに、どれだけ楽しみを見いだせるか...ですね。何事にも興味を示すことができる方なら、大丈夫でしょう。大系だった情報収集をしていってください。

いまどきのパソコンのようにはならなくても全然かまいません。
とりあえず「素人ならこれくらいのレベルで結構快適に使用できる」ぐらいで構いません。
その場合ＣＰＵやＨＤＤ(容量か不足)等も考慮したいのですが。
費用は検討がつかないので、ここまで改造したらこの位かかりますと教えて頂けないでしょうか？いろいろご無理をいって申し訳ありません。よろしくお願いします。

＞とりあえず「素人ならこれくらいのレベルで結構快適に使用できる」ぐらいで構いません。

うーん、これが難しいんですよね(^^;)
素人と仰られてもどの程度のスキルをお持ちなのかがわかりませんし・・・・
ましてやどこからが素人でどこからがそうでないかといった線引きも難しいですしね。

恐らく具体的にこんな事をしたいとか、こうなればいいなとか言ったことが思い浮かばないのか言い表せないのかと思いますが、出来ればもう少し具体的に使用目的を明確になさった方がいいかと思いますよ。
その方がより具体的なアドバイスを得られるでしょうし、情報としても有益なものになるでしょう。
で、どの程度をもって「快適」とするかというのは主観的に判断するしかない部分が多いので難しいのですが、現行のPC/AT互換機に匹敵するような性能となるとかなりのパワーアップをしなければならないでしょうし、所詮は追いつけないでしょう。（悲しいかな）
私はXa13/W12をパワーアップして使っていますが、現在市場に出回っている安価なメーカー製パソコンよりは使いやすいものになっています。けれど最新のスペックの互換機にはとうていかないません。もっとも比べること自体が無意味ですけどね。
（しかも費用もかなりかかっています（汗））

もしも具体的な使用目的などが明確にならないのであれば、「今はCt20を***な用途に使っているが、XXXな所が不満です。」とか「あるPCを使ってみると自分のCt20とこんな所が違っていたが、あんな風になるものなのか？」とか言った感じで質問してみるといいかもしれませんね。
パソコンは使用用途とか使うOSやアプリケーションによって大きく使い勝手が変わる場合もありますので、なるべく最終目標を明確にしてパワーアップなさるといいと思いますよ。
費用はその投資方法によってまちまちですので何とも言えませんね。500円程度で満足のいく改造もあれば、それこそ数十万円単位での改造もありますので。
（改造は工夫次第で効果がアップしますからね。）
具体的な金額提示など出来なくて申し訳ないのですが、そこら辺をもう少し検討してみてください<(_ _)>

ご丁寧なレスありがとうございます。
とりあえず現状はＯＳはＷｉｎ９５を使用していますが改造後Ｗｉｎ９８以降に変更はしたいと思います。あと今はまだインターネットに接続してないので(このかきこは会社のパソコンから)動作環境は分かりませんが、不満に思うことは処理能力が遅いのとＨＤＤの空き容量が不足していることです。そこら辺を考慮しつつ、更にもう少し改造してみたいのですが・・。
またまたあいまいな表現ですみませんがよろしくお願いします。

とりあえずWindows98が快適に動くスペックとのことなのでCPU、HDD、GAの抜本的強化が必要になります。

CPUはメルコのK6-2+搭載アクセラレータが入手性と性能の点で一番無難なところでしょう。K6-2+/500MHz搭載の製品が確か3万以下でした。
HDDは標準のHDDが接続されているインターフェースは遅い＆4.3GBまでのHDDしか使えないという弱点がありますので、UIDE-66やSCSIインターフェースボード等と高速なHDDを導入すればアプリケーション等の起動が見違えるように速くなります。コストを重視するならUIDE-66、お金はかかっても外付けSCSI機器も使いたい場合はSCSIボードを導入するといいでしょう（Ct20だと標準でSCSI-2のインターフェースボードが装着されていると思いますが、高速化を考えるとこれは外した方がいいかも）。後はグラフィック性能を強化するためにビデオカードを導入・・・といきたいところですが、ここまでやると7〜8万円くらいはかかると思いますので、性能と予算を天秤にかけて慎重にパワーアップ計画を立てた方がいいでしょう(^^;;)。

こんばんは。Ct20使いのゆーです。
＞処理能力が遅いのとＨＤＤの空き容量が不足している
これはCPU交換とハードディスク交換で解決できると思います。
メルコから出ているCPUアクセラレータ、HK6-MD533P-NV4がいいと思います。
それとI・O DATAから出ているUIDE-66と一般に市販されているU-ATA66対応のハードディスクの組み合わせがいいと思います。ただし、ハードディスクは32GBまでです。
あと、メモリを128MBにするとかですね。ですが、これを全て実行するとかなりの費用が掛かってしまいます。ですから、CPUノーマルのままでUIDE-66と一般に市販されているU-ATA66対応のハードディスク組み合わせにするのはどうでしょう？標準のハードディスクに比べてかなり速くなって、体感できると思いますよ。

ＷＩＮ９８が快適って所にも難しいものがありますね。
普通に、インターネットとメールをするぐらいなら、ＨＤＤを５４００ｒｐｍの４．３Ｇ・ＣＰＵをＫ６―３―４００もしくはＫ６―２＋アクセラレーター＋メモリー最低９６ＭＢでも良いような、これでも５〜６万ぐらいでしょうか。
上を見ればそれこそ２０万位は行ってしまうので、やっぱりどれぐらいお金をかけられるかにもよりますよ。（ＰＣ９８でバリバリに改造されている方々は、信じられないぐらいのお金をかけてます、どの辺までって言う線引きをしないとえらい目に会いますよ）

私のCt20は、電源交換とHDD3台内蔵(UIDE-98接続っす)しているくらいなのですが、
電源交換は安心のためにやったほうが良いかもしれません。

ＷＩＮ９８が快適か、わかりませんが,CPUとHDDを変えると言いと思います。インタネットをやるだけなら,GAは、いれないでも行けるのではないでしょうか？

参考になるかわかりませんが、私は先日もらったPC9821Xa12を
メモリ64MB ＝ 9000(合計96MBになりました)
CPUPentium200 ＝ 4480(元あったPentium120は撤去)
CPU FAN ＝ 495
ＨＤ4.3GB２本 ＝11960(WesterDigital製合計8.4GB)
モデム28.8K ＝ 2980(PC9801-120だったかなぁ？）
GAミレニアム2M＝ 1980　を全部中古で調達しWin98をインストールしました。
今のエントリーモデルと比べても能力的には低いですがダイヤルアップでインターネットに接続したり、家でWordやEXCELをする程度には使えています。

私はCt16ですが、同じようなものなので、、そこで、まずGAの増設には注意が必要です。
通常の2D(+3D)なボードは対応している物はありません。
理由は本体にRGB入力が無い為ですが、一応モニターの切り替え機や2系統入力なモニターを使う事で使用する事が出来ます・・・・・ただし98TVが使用できなくなります。
3D専用ボードならこの問題は関係ありません。
この辺の回避作はCt20をキーワードに過去ログ検索すると出てきますので参考にされると良いでしょう。

HDDに関しては皆様が書かれている通りですが、Ct20はSCSIのCD-Rが標準だったと思うのでIFC-USP-M2にてIDEなHDDとSCSIなCD-Rを共存させればPCI一本である程度高速な環境が入手可能です。

CPUに関してはまぁ高速な方が有利なのでK-6-IIIやK6-2+搭載がお勧めですが無ければP54C-200でもそれほど困らないと思いますので良い出物が出るのを待つのも手です。
最近はPK-K6HX400が10000円以下で有ったりHK6-MD466-N3が5000円以下であったりしましたからそう言うのをゲット出来れば幸せです(笑)

私のCt16はCPUにHK6-MS333-N2000、MEM64MB、GAは標準+Voodoo2(12MB)、HDDは内蔵に標準のHDD+SC-PCI経由で外付け2.1GB(状況によって8.4GBにもします)、といった環境でそれほど遅いとは感じない程度にはなりました。

あ、音源について忘れてました。
Ct20はCt16と違いMIDIがソフトウェアになってしまったので、MIDIを聞く際に負荷がかかり遅くなってしまいます。
そこでMIDIドーターカードを追加するかシリアル経由等で外部MIDIを追加すると処理も軽くなりますし追加する音源によって質も向上します。
PCIに音源を追加する事も可能ですが他の増設が手詰まりになってしまうので余りお勧めは出来ません。
どうせならUSBボードを挿してUSB音源を導入すると選択肢も広がると思います。
PCI音源もUSB機器も大抵98非対応なので導入の際には過去ログ検索で可能性の高い物を選ぶとよろしいでしょう。＜動作保証はありませんが、、

いろいろと教えて頂きありがとうございます。
さっそく検討してみたいと思います。