#さらに書き直して再々投稿ですm(_ _)m。
私のV16S5VC2でも起こりました。
過去ログ
http://www.cham-reo.com/logsearch/archive/stage_2/maniax/sled06139.htmlで、TOMOE HOTARUを使用して領域確保を行った場合の、Norton Disk Doctor、Speed Diskなどでエラーになる原因について触れられていますが、おそらく他のツールで領域確保した場合もこれと同じではないでしょうか。Nortonに限らず、「ドライブの諸元取得をOSに頼らず自力で取り直すタイプのツール」だとエラーになるようです。
なお、Norton Disk Doctor、および、Norton System Checkの中のHard Drive Integrity Scan(Norton Disk Integrity)は、Safe モードでなら実行できるようです。Speed DiskはそもそもSafe モードでは実行できない仕様みたいなので無理かも知れません。この辺を気にするなら、素直にUIDE-66やIFC-USP-M2を使った方がいいのかも知れませんね。