結論から言うと、パフォーマンスアップします(^^)
HDBENCHの結果で、２倍くらいになると思います。
私は、Xv20にUIDE-98を導入した時、HDBENCHの測定結果で、
3.5MB/sec → 7MB/secと２倍になりました。
この２倍は体感差が出ますね。

ただ、V12となると、PCIバスは１本ですからね(^^;
PCIバスはＧＡの為に使って、ＣバスにSCSIボードを挿して、
外付でSCSI化した方がいいかもしれません。
（でも、Ｃバスとあって転送速度は期待しない方がいいです(^^;）
もし、隠れPCIのある当たりロットならば、隠れPCIに迷わずUIDE-98を挿しましょう(^^)

＞Ｖ１２オリジナルの８５０ＭＢクラスのＨＤＤを取り付けた場合でもパフォーマンスアップは期待してもよいのでしょうか。
さほど変わらないと思います。

＞遅いほうのＨＤＤに足を引っ張られる
組み合わせ次第かと思いますが、Xc13/S5B2に内蔵されていた1.6GとDJNA35****を組み合わせても足を引っ張ると言う事は出ませんでした。

＞私は、Xv20にUIDE-98を導入した時、HDBENCHの測定結果で、
＞3.5MB/sec → 7MB/secと２倍になりました。
Ｘｖ２０に内蔵されているのは３ＧのＨＤＤの為速度差が出てきますが、８５０ＭＢクラスだとオンボードインターフェースでも速度的に間に合っている為UIDE-98の能力の恩恵には授かれません。

８５０ＭＢでしたらデータドライブとして使えますから、UIDE-98(M)と新しいHDDを組で購入する方が得策です。(速度を期待するのなら)
そのうえで８５０ＭＢをスレーブ接続してみて、何か問題が出るようで有ればセカンダリ接続でも良いのではないでしょうか？

HDDがDMAに対応していればCPU負荷が減ると思うのでいいかもしれません。
CD-ROMもDMAに対応していればなおさらいいかも。
でもPCIが１本ならKei-XさんのかかれているようにGAをさしたほうがいいと
思います。

いろいろアドバイスありがとうございます。ちゃんと書けば良かったのですが、取り付けたい機体はXa７です。Ｖ１２についていたHDDが余っていたのであのような標記をしてしまいました。GAとUIDE-98の組み合わせでやってみます。８５０ＭＢのHDDはデータドライブとしての利用を考えていたので、もし８５０ＭＢのHDDが足を引っ張るようでしたら、いーとんさんのおっしゃるとおりセカンダリ接続でチャレンジしたいと思います。

850MBの頃のは、U-DMAも非対応だし、AUTO設定で使うとデータバケしやすいのでご注意を。速さ的には、みなさんかいておられるとおり、改善の度合いは低いです。540MB帯では意味無し、1.2GB帯では意味有りという中間ですね。

昔、Ｘａ７ｅの標準シーゲイトの８５０Ｍドライブで、ＨＤＢＥＮＣＨ２．４４　ＲＥＡＤ、ＷＲＩＴＥ共に１７００程度だったものが、ウェスタンディジタルの３．２Ｇに変えたとき２７００程度に速度アップしました。
従って、８５０Ｍ程度では、悪評高いＰＣ−９８の標準ＩＤＥインターフェースでも能力が余っていると言うことになります。