はじめて書込みさせていただきます。

これまで過去ログなどを参照させていただき、無難にPC98強化を行ってきたのですが、
今回は無茶なことをやってしまい、発生した問題を解決出来そうにないため、ご相談
させていただくことにしました。
長文になってしまって申し訳ありませんが、最後まで目を通していただければ幸いです。

事の発端
　M社外付けSCSI-HDD40GBの中身（Maxtor4D040H2）を外し、I社外付けSCSI-HDD（HDVS-
　UM30G、マルチドライブ対応、中身はQuantumFireball lct10でした）に入換え。以下の環境
　で接続したところ、1回目電源ONで画面真っ暗。2回目以降の電源ONではメモリカウント後の
　SCSI-BIOS読込み表示が行われず、システムディスク要求画面に移行。

　PC : PC9821Xv20/W30
　OS : Windows98SE(Aドライブ）
　　　 Windows2000（Bドライブ）
　CPU：K6-IIIE+550＠600+HK6-NV4下駄
MEM: 32MB+128*2MB(PK98-128MX2EDO)
　　　　　まりも氏ソフト
(SIMM128.EXE　Version 3.30)
2ndキャッシュ:本体標準のもの使用
　GA：GA-PIIH8/PCI
　GA：GeForce2MX400(inno) *W2K時
　SCSI-IF：Chanpon3
　ABドライブ:Ultra2WideSCSI 18GB
　　（Quantum AtrasV）
　C-ドライブ:UltraSCSI外付け
　（今回入換えしたHDD）
　?ドライブ：CD-R/RW/DVD
　　　　　 Logitec LCW-R2010DVAK
　　　　　　+AEC-7720U
　　*Chanpon3内蔵UltraSCSI接続
　その他　USBハブ（玄人志向5インチベイ内蔵）
*Chanpon3より
　　　　　PCMCIAスロット　PC9821V-E04
　　　　　　　　*Cバスより
　　　　　内蔵2ndCCU、音源、IDE切り離し

発生した問題１<Chanpon3側>
　・Chanpon3の赤LED点灯がどうやっても解除されない（全てのデバイスを外し、CPUを元
　　に戻し、メモリ標準搭載に戻して再起動しても不可）。
　・BIOS再書き込みにトライするもChanpon3のBIOS書込み時にPCI上にデバイスが無いと
　　表示される（PCIセットアップ画面では認識されている）。
　・新品Chanpon3で試しても同様の状態。
　　
発生した問題２<PC98Xv20側>
　・Windows98SEの起動ディスクから起動するとconfig.sysの読込み後あたりで必ず
　　”ドライブBに挿入しようするディスクをドライブAに挿入して下さい
　　　挿入が終わったら、適当なキーを押して下さい”
　　が出て、リターンを押すと
　　”ドライブAにディスクを挿入して下さい
　　　挿入が終わったら、適当なキーを押して下さい”
　　が出て、再度リターンを押すとautoexec.batが実行される。
　・この状態は何をしようと再現する（全てのデバイスを外し、CPUを元に戻し、メモリ標準
　　搭載に戻しても起こる）。
　・またVzエディタを立上げドライブを表示すると、Bドライブが=B=表示となっている。

　　但し、起動時Helpメニュの内蔵ＦＤ番号 #3、#4を内蔵ＦＤ番号 #1、#2に変更すると
　　上記現象は起こらない。

まず問題２を解決するのが先決かと思いますが、標準装備への戻し、またESC+Help+9など
でも再現したため、これ以上方法が思い当たらない状況です。
最終手段としては、Xv20/W30本体購入+新品Chanpon3が間違いないところと思っています
が・・・。

ご迷惑をおかけしますが、アドバイスよろしくお願いいたします。