CバスLANボードを使うために2ndCCUを使用しない設定にしたため、シリアルマウスが使えなくなった。
と言うことなら、USBマウスにするか、使っていないならモデムボードを抜くとか、PCIのIQRをシェアリングさせるとか。

ｇａｍｏさん、ありがとうございます。
モデムボードなんですが抜いてみたんですが、その後がどうした良いかわからず諦めていたんです。ＩＱＲをシェアリングさせるとはどういう事なんでしょう。ごめんなさい、よく分らないのです。教えてもらえないでしょうか？

>ＩＱＲをシェアリング
　タイプミスか何かだと思いますが「ＩＱＲ」ではなく「ＩＲＱ(ＩnterruptＲeＱuest：割り込み要求)です。
　V166なら最低でもWin95OSR2以降なのでPCIデバイス同士ならIRQを同じにできる組み合わせがあります。マシン添付のPCIセットアップディスクを用いてPCIデバイスのIRQを同じに出来る組み合わせがあると思います。場合によってはWin95(Win98なども同様かな？)起動時にハングアップするものもあります。(自分の環境ではオンボードLANとSCSIだかGAだかをIRQ同じにすると起動時にハングアップしました。PC-9821Xv13/W16環境です。)
　補足しますとIRQとはCPUの動作時に外部のデバイスアクセスがあるときCPU処理中に割り込みを要求して効率よく処理を行うといった意味があったと思います。割り込みはある程度の秩序があり、優先順位が決まっていたと思います。IRQは全16個あり、そのうち１つはカスケードといって二つの割り込みコントローラ(１つの割り込みコントローラは８つの割り込みを有す)をつなぐために使われているため個別に割り当てられるのは15個になります。15個分だと足りなくなるのでシェアリングという方法が用いられるようになりました。
　PC-9800だとユーザ側で自由に使用できるIRQは3,5,6,9,10,12,13(13は事実上バスマウスで使用されていて切り離しが出来なかったと思います。)です。古い98のマニュアルだと順にINT0,1,2,3,41,5,6という記述があります。上記に無いIRQはシステムで予約されているのでユーザは自由に使用することは出来ません。(一部誤りや説明不足があった場合は申し訳ありません…。)

あぁ、ゴメン。f(^_^;

名古屋の者 さん、具体的なアドバイスが欲しいなら、とりあえずLANボードとSCSIボードのメーカーと型式を書いてもらえませんか？
それと、Windowsのデバイスマネージャで、現在のIRQ使用状況を調べて書いてもらえませんか？

"名古屋の者"というくらいだから、Melco LGY-98だったりとか（深読み？^^;)

遅くなってごめんなさい。具体的なアドバイスほしいです。
まず、ＬＡＮボードですが”まりも”さんの読みどおり”ＬＧＹ−９８”です。
ＳＣＳＩボードは”ＩＦＣ−ＵＳＰ−Ｍ２”です。
ＩＲＱの使用状況は”00システムタイマ””01ＮＥＣＰＣ−９８００シリーズキーボード”
”02スタンダードディスプレイアダプタ””03ＳＣＳＩ””04通信ポートＣＯＭ１”
”05ＬＧＹ−９８””06ＭＧＡ−１０６４ＳＧ（Ｍａｔｒｏｘ）”
”06ＮＥＣ　ＰＣＩ　ｔｏＵＳＢ　Ｏｐｅｎ　Ｈｏｓｔ　Ｃｏｎｔｒｏｌｌｅｒ”
”06ＰＣＩステアリング用ＩＲＱホルダ””06ＰＣＩステアリング用ＩＲＱホルダ”
”07プログラミング可能な割り込みコントローラ””08数値データプロセッサ”
”09スタンダードＩＤＥハードディスクコントローラ””11標準フロッピディスクコントローラ”
”12YMF701互換Soundsystem（拡張FMのみ）””13標準バスアダプタマウス”
”14プリンターポート（36pinparallelinterface）（LPT1）””15システムＣＭＯＳ/リアルタイムクロック”
でした。アドバイスよろしくお願いします。

＞05ＬＧＹ−９８
これが、2nd CCUポートで使うべき割り込みを食ってしまっていますね。
次のようにしてみてください。
１．　「システムセットアップメニュー」で「2ndCCU」は「使用する」にする
２．　「PCIセットアップユーティリティ」を起動し、PCIボードのうちIFC-USP-M2が入っているほうのスロットのIRQを、10に設定する。
３．　LGY-98付属のLGYSETUPを起動して、IRQの割り当てを 3 にする。
４．　Windowsを起動し、デバイスマネージャから、LANアダプタのLGYSETUPの設定タブを選び、そこにあるIRQの割り当てを 3 に変更する。再起動すれば万事OKになります。

ただしこの状態での運用では、PCIセットアップの設定がなんらかの理由で初期化された場合に、SCSIからの起動が出来なくなる可能性があるので、注意して下さい。もしそうなった場合は、一旦LGY-98のボードを抜いて、１．からの手順をやり直します（３．以降は不要でしょう）。

　もし、「PCIセットアップユーティリティ」って何？　という状態でしたら、バックアップCD-ROM内を探して下さい。それすらない場合は、2ndCCUに繋ぐのは諦めて、USB接続のホイールマウスを買うなどして下さい。

補足ですが、内蔵音源のMIDIは使わない設定にしておいてください。使うのであれば、もうIRQの空きがないので、USBマウスの導入しかありません。
＃　どうであってもUSBマウスのほうが滑らかに動くので気分がよいですが(^^;。

また、遅くなりましたが”まりも”さん、ありがとうございます。
明日にでも、実行してみます。
初心者なのでまた書き込むかもしれませんが、その時はよろしくお願いします。

”まりも”さんいますか？
教えてもらった事を実行しました。しかし、まず、2ndCCUを”使用する”に変更できず、
ＬＧＹＳＥＴＵＰを起動してもＩＲＱの割り当てする所がなく、うまくいきません。
モデムが外してあるのがいけないのでしょうか？
もう一度アドバイスお願いします。