新しくPCIタイプのVGAカードが発売されるたびに、PC-9821で使えるかどうかということが話題になりますが、100%確実にBIOSを「飛ばす」方法がようやくわかったので報告します。
ただし、BIOSを飛ばしても、「メモリカウントの直後にハングアップ」しなくなるだけで、Windows2000などが動作することを保証するわけではありませんので、念のため。

まず、マシンの起動時にハングアップするボードは、当然のことながらBIOSの書き換えが必要です。BIOSの書き換え中に電源を切ったりする、いわゆる「BIOS飛ばし」と呼ばれる技を使って成功する場合もありますが、成功率が低いですし、故障につながる可能性もあるので、精神衛生上よくありません。
最悪、そのボードがAT互換機でもまったく動作しなくなってしまう可能性もあります。

そこでPCI規格のデータシートを見ると、BIOS ROMの中には「PCIデータストラクチャ」という領域があり、その中に「コードタイプ」という1バイトのデータが書き込まれています。PC-9821本体のBIOSはこのバイトをチェックして、0x00ならBIOS ROMの初期化ルーチンにジャンプするという処理を行っています。これを0x01に書き換えてしまえばパソコン本体のBIOSはビデオカードのBIOSに制御を移さなくなるため、絶対にここでハングアップすることがなくなるのです。

「コードタイプ」の書き込まれている位置の具体的なアドレスですが、これはBIOSのバージョンが変わると移動する可能性があるので、新しいビデオカードやBIOSが出るたびに調べなくてはなりません。
まず、BIOSのROMイメージデータファイルをバイナリエディタなどで開きます。
そして、先頭からのオフセットアドレス0x0018〜0x0019に格納されているワードデータを見ます。そして、このワードデータに0x0014を足した物が、コードタイプが書き込まれているオフセットアドレスになるのです。
あと、BIOS ROMイメージファイルの末尾のバイトは、ファイル全体のチェックサムになっていますので、コードタイプを書き換えると同時に、チェックサムを1減らさなくてはなりません。つまり、書き換えるのは合計で2バイトになります。

以上の処理を自動的に行うプログラムを作成すれば、どんなビデオカードにも使える汎用の9821対応BIOSパッチプログラムができあがります。
最新のカードだけでなく、過去に発売された様々なビデオカードの動作報告を期待したいところです。
応用としては、メルコのWGP-FXが著作権の問題なしに98で使えるようになる可能性もあるので、誰か試してみませんか？